全長30cm。体側後方に黒斑がある。クロホシフエダイに似るが、頭部の側頭部の鱗列が4〜5列（クロホシフエダイは1〜2列）であることや、背鰭軟条数が通常13（ニセクロホシフエダイは14）であることで区別できる。幼魚や若魚の時にみられる体側の縦帯はクロホシフエダイが褐色であるのに対してニセクロホシフエダイは黄色である。