ハナビヌメリの仲間は5cm前後の小型種が多い。本種も体長6cm前後である。体側の側線は直線状で湾曲しない、前鰓蓋骨外側基部に前向突起があることでヒメテグリと区別できる。同属内での近縁種とは、前鰓蓋骨の内向棘は3−4棘であり、それはコガタハナビヌメリよりも大きい、雄成魚の吻端が下に向かって尖らないなどの特徴により区別できる。