色彩、斑紋、形態は変異に富み、いくつかのタイプに分かれている。橙色型は雄の尾鰭に明瞭な橙色斑があり、尾鰭に点列が見られない。偽橙色型は橙色型に似るが、雌の尾鰭に点列がある。縞鰭型は雌雄ともに尾鰭に点列によって形成される縞模様がある。宍道湖型は尾鰭に点列がなく、橙色型に似るが雄の尾鰭橙色斑は明瞭でないことなどで区別される。このほかにもいくつかのタイプがあるとされる。いくつかのタイプでは第1背鰭の先端が尖る。アヤヨシノボリやカワヨシノボリに似ているが、本種は頭部に瑠璃色斑がなく、胸鰭軟条数は19〜22とカワヨシノボリと比べて多いことで区別できる。体長は普通5〜6cmだが、陸封型ではさらに小さいものも見られる。