体長2.5〜4cm。ミミズハゼ属に似るが、小さな第1背鰭を有する。シロクラハゼ属の軟条は4本以上遊離するが、セジロハゼ属では2本以下。本種では2本伸長し、眼下に白いひげがあり、その下に暗色斑があることで他の種と区別できる。