ゲンコの仲間は鼻孔が一対、口の後端は下眼後縁に達しない、眼が大きいなどの特徴を持つ。本種はその中でも有眼側の背鰭および臀鰭軟条に小茶褐色の斑点があることでヒレグロゲンコと、有眼側の腹部の側線を欠くことでオキゲンコと区別できる。体長15cmほどの小型種。